Μια ασθένεια ονόματι Geostigma μαστίζει τον κόσμο. Ο κεντρικός ήρωας Κλάουντ Στράιφ, θα πρέπει να αντιμετωπίσει τρεις μυστηριώδεις άντρες που απαγάγουν μικρά παιδιά και τους κάνουν πλύση εγκεφάλου. Στο πλευρό του θα σταθεί η Τίφα Λόκχαρτ, η οποία είναι πλέον ιδιοκτήτρια ορφανοτροφείου και φυσικά ο Βίνσεντ Βαλεντάιν...

Η ταινία βασίζεται στο επιτυχημένο ηλεκτρονικό παιχνίδι ρόλων Final Fantasy VII και είναι σχεδιασμένη αποκλειστικά από υπολογιστές.