Τα μυθικά Πόκεμον Genesect κάνουν και πάλι την εμφάνισή τους κι εξαπολύουν επίθεση στην πόλη. Ο Ας, ο Pikachu κι η υπόλοιπη παρέα θα βρεθούν στο μάτι του κυκλώνα. Και τότε, ο θρυλικός Mewtwo έρχεται να πάρει μέρος στη μάχη...