O Γκιμπς δίνει μάχη για να κρατηθεί στη ζωή μετά τον σοβαρό τραυματισμό του από τον Λουκ Χάρις. Τα νέα της κατάστασης του επηρεάζουν βαθιά όλη την ομάδα NCIS και όλοι ελπίζουν πως ο δρ. Σίριλ Ταφτ θα του σώσει τη ζωή.
Ο Γκιμπς ζητάει από την ομάδα NCIS να συνεργαστεί σε μια υπόθεση με τον πράκτορα της Δίωξης Ναρκωτικών, Λούις Μίτσελ, για να συλλάβουν έναν έμπορο ναρκωτικών και να βάλουν τέλος σε μια παλιά ιστορία.
Ένας πεζοναύτης καλεί τον Γκιμπς για να κανονίσουν ένα ραντεβού και να συζητήσουν μια υπόθεση αλλά λίγο αργότερα βρίσκεται νεκρός. Η ομάδα NCIS αναλαμβάνει την έρευνα της δολοφονίας.
Η ομάδα NCIS ερευνά τη δολοφονία ενός δόκιμου και ανακαλύπτει ότι συνδέεται με έναν πρώην ειδικό πράκτορα του NCIS, ο οποίος είχε εκτίσει ποινή για κλοπή.
Η Άμπι επισκέπτεται ένα εργαστήριο φαρμακευτικής για τις ανάγκες της έρευνας μια δολοφονίας. Το κτίριο όμως καταλαμβάνεται από ένοπλους άντρες, που τους κρατάνε όλους ομήρους.
Η ομάδα NCIS πρέπει να καθορίσει αν η δολοφονία ενός υπαξιωματικού είναι το τελευταίο θύμα ενός δολοφόνου ή το έργο ενός μιμητή, όταν τα στοιχεία, που συνθέτουν τη δολοφονία, ταιριάζουν με τον τρόπο δράσης και τις μεθόδους ενός τοπικού κατά συρροή εγκληματία.
Η ομάδα NCIS ερευνά την υπόθεση δολοφονίας ενός συνταξιούχου Πλωτάρχη του ναυτικού, του οποίου ο γιος είχε καταδικαστεί για δολοφονία πριν από 16 χρόνια. Η τροπή της υπόθεσης αναγκάζει τον Ντάκι να αποκαλύψει τη συμμετοχή του σε μια μυστική 'αδελφότητα'.
Όταν μια ομάδα εθελοντών γιατρών δέχονται επίθεση στο Νότιο Σουδάν, ο ειδικός πράκτορας Σταν Μπάρλεϊ, ζητάει τη βοήθεια της ομάδας NCIS. Με αφορμή αυτή τη συγκυρία, ο Ντινόζο επανασυνδέεται με την πρώην φίλη του, Τζιν Μπενουά.
Ένας υπαξιωματικός, κατηγορείται για τη δολοφονία της πρώην φίλης του αλλά αφήνεται ελεύθερος λόγω κακοδικίας. Ο νεαρός επιμένει να υποστηρίζει την αθωότητά του και ζητάει από την ομάδα NCIS να ερευνήσει την υπόθεση και αν χρειαστεί να περάσει στρατοδικείο.
Ο υπουργός Άμυνας ζητάει τη βοήθεια της ομάδας NCIS για μια ειδική αποστολή. Τους ζητάει να εντοπίσουν τον μοναδικό αδελφό ενός ναύτη, που πάσχει από λευχαιμία, οποίος μπορεί να είναι συμβατός δότης μυελού των οστών και να του σώσει τη ζωή.
Ο Ντάκι δέχεται επίσκεψη από έναν άνδρα, που ισχυρίζεται ότι έχει πληροφορίες σχετικά με τον ετεροθαλή αδελφό του, ο οποίος πέθανε πριν από δεκαετίες. Η ομάδα NCIS αναζητά τον δράστη.
Πέντε άτομα βρίσκονται νεκρά σε ένα ιδιωτικό επιβατικό αεροσκάφος κατά την πτήση και η ομάδα NCIS ερευνά τον τρόπο, που έχασαν τη ζωή τους. Ωστόσο, η υπόθεση παίρνει νέα τροπή όταν αποκαλύπτεται πως ένας από τους επιβάτες ήταν ο αδερφός της Άμπι.
Η έρευνα για τη δολοφονία ενός ναυτικού, που ήταν μάρτυρας σε μια δίκη, αποκαλύπτει την επανεμφάνιση ενός διεθνούς κυκλώματος διακίνησης ανθρώπων. Ο ΜακΓκι ελπίζει να περάσει τη νύχτα στο σπίτι μιας συναδέλφου μετά από μια καταιγίδα, που προκαλεί διακοπή ρεύματος στην πόλη.
Όταν ένας δύτης δολοφονείται κατά τη διάρκεια της δουλειάς του, το σώμα του και οι ύποπτοι συνάδελφοί του, θα πρέπει να παραμείνουν σε ένα θάλαμο αποσυμπίεσης υψηλής τεχνολογίας για τέσσερις ημέρες, αφήνοντας την ομάδα NCIS να ολοκληρώσει μια ανορθόδοξη έρευνα έξω από τη δεξαμενή.
Όταν η Γραμματέας του Πολεμικού Ναυτικού, Σάρα Πόρτερ, μαθαίνει ότι η κόρη της έχει πέσει θύμα απαγωγής, η ομάδα NCIS συνεργάζεται με το FBI για να ερευνήσουν την υπόθεση, να καθορίσουν το κίνητρο και να επιστρέψουν τη μικρή σώα σπίτι της.
Ο δρ. Σίριλ Ταφτ βιώνει την ένταση, που νιώθουν οι πράκτορες της ομάδας NCIS, όταν ο Γκιμπς ζητάει τις χειρουργικές του γνώσεις και του αναθέτει ένα καθήκον, που μπορεί να τους δώσει βασικά στοιχεία για μια σημαντική υπόθεση.
Τα προσωπικά σχέδια των πρακτόρων της ομάδας NCIS αναβάλλονται όταν όλοι τους ανακαλύπτουν λάθη σε μια φαινομενικά εύκολη υπόθεση. Επίσης, ο ΜακΓκι και η Ντελάιλα διαφωνούν στο πόσο σημαντικό είναι να μην συζητούν θέματα δουλειάς κατά τη διάρκεια του δείπνου.
Ο Γκιμπς προσπαθεί να επικοινωνήσει με έναν τραυματισμένο ελεύθερο σκοπευτή των Ειδικών Επιχειρήσεων όταν ένα ζευγάρι Αμερικανών δέχονται επίθεση στην ίδια περιοχή στο Ιράκ, όπου έπεσε σε ενέδρα η ομάδα του ελεύθερου σκοπευτή.
Η σύζυγος και η ερωμένη ενός αξιωματικού του Ναυτικού κατηγορούν η μία την άλλη για τη δολοφονία του. Η ομάδα NCIS πρέπει να αποκαλύψει ποια από τις δύο υπόπτους λέει ψέματα.
Ένας γερουσιαστής κατηγορεί τον Ντι Νόζο ότι τον εκβιάζει. Η ομάδα NCIS αναλαμβάνει τη διερεύνηση της περίεργης αυτής καταγγελίας και τα στοιχεία που συγκεντρώνουν δείχνουν ότι άλλοι δύο γερουσιαστές βρίσκονται υπό την απειλή και τους εκβιασμούς του Τόνι Ντι Νόζο.
Η ομάδα NCIS συνεργάζεται με το FBI όταν δύο Βρετανοί κρατούμενοι, συμπεριλαμβανομένου ενός πρώην κατασκόπου, δραπετεύουν και φθάνουν στις ΗΠΑ μέσω ενός κοντέινερ. Εν τω μεταξύ, ο ΜακΓκι αναρωτιέται πως ο Ντι Νόζο κατάφερε να αγοράσει το υπέροχο, πολυτελές διαμέρισμά του.
Όταν ένας 14χρονος, γιος πεζοναύτη, αποτρέπει μια εισβολή αγνώστων στο σπίτι του, ο Γκιμπς υποψιάζεται πως ο έφηβος έχει αποκρύψει σχετικές, αλλά πολύ σημαντικές λεπτομέρειες της υπόθεσης απόδρασης ενός Βρετανού κατασκόπου.
Ο Φορνέλ είναι σε κρίσιμη κατάσταση μετά από τον σοβαρό τραυματισμό του στο σπίτι του Γκιμπς. Η ομάδα NCIS τοποθετεί όλους τους ανθρώπους, που βρίσκονται στη λίστα του εκτελεστή Τζέικομπ Σκοτ σε προστατευτική επιτήρηση, εκτός από δύο αγνοούμενους, πρώην πράκτορες του NCIS.
Μετά την επίθεση και τον θάνατο της Ζίβα Νταβίντ, που προκαλεί μεγάλη θλίψη σε όλη την ομάδα NCIS, ο Τόνι προσπαθεί να μαζέψει τα κομμάτια της ζωής του ενώ η υπόλοιπη ομάδα συνεχίζει να κυνηγάει τον φυγά Τρεντ Κορτ.
Μετά την επίθεση και τον θάνατο της Ζίβα Νταβίντ, που προκαλεί μεγάλη θλίψη σε όλη την ομάδα NCIS, ο Τόνι προσπαθεί να μαζέψει τα κομμάτια της ζωής του ενώ η υπόλοιπη ομάδα συνεχίζει να κυνηγάει τον φυγά Τρεντ Κορτ.
