Ο Νόρτον έκανε το σκηνοθετικό του ντεμπούτο με τη ταινία Keeping the Faith το 2000, στην οποία συμπρωταγωνίστησε με τον Ben Stiller. Η ιστορία της ταινίας αφορούσε ένα καθολικό ιερέα και ένα ραββίνο που ερωτεύονται την ίδια γυναίκα, ενώ ένα χρόνο αργότερα τον είδαμε στο The Score, μαζί με τους Marlon Brando και Robert De Niro. Μαζί με την μνηστή του Salma Hayek συμπρωταγωνίστησε το 2002 στο Frida, στο οποίο συμμετείχε και σαν σεναριογράφος. Ακολούθησαν το Red Dragon, prequel του ιστορικού Silence Of The Lambs καθώς και το 25th Hour του Spike Lee, στα οποία είχε πρωταγωνιστικούς ρόλους.

Το 2003 είχε έναν μικρό ρόλο στο The Italian Job. Όπως έγινε γνωστό αργότερα, συμμετείχε στη ταινία εξαιτίας της εταιρείας παραγωγής, στην οποία και κατά κάποιο τρόπο "χρωστούσε" αυτή τη χάρη. Το 2005 υποδύθηκε τον εαυτό του στο πειραματικό show Stella ενώ κέρδισε διθυραμβικές κριτικές υποδυόμενος τον βασιλιά της Ιερουσαλήμ στο Kingdom of Heaven, στο οποίο δεν εμφανίστηκε καθόλου με το πρόσωπο του ούτε υπήρχε στους τίτλους τέλους της ταινίας.

Ακολούθησαν τα Down in the Valley και The Illusionist. Στο πρώτο υποδύθηκε έναν καουμπόι του σήμερα και στο δεύτερο έναν μάγο. Στο The Illusionist μάλιστα συμπρωταγωνίστησε με τον πρώην συμφοιτητή του Paul Giamatti.

Πέρα από την επιτυχημένη καριέρα ηθοποιού που έχει χτίσει, o Έντουαρντ Νόρτον συμμετείχε σε πολλές απο αυτές σαν σεναριογράφος αλλά και σαν παραγωγός. Αυτές είναι τα Keeping the Faith, στην οποία είχε πρωταγωνιστικό ρόλο, ήταν παραγωγός και σκηνοθέτης, το Down in the Valley στο οποίο συμμετείχε και σαν παραγωγός ενώ έκανε και τη παραγωγή του The Painted Veil. Επίσης έχει συμμετάσχει στην παραγωγή των A Soldier of the Great War, Buffalo for the Broken Heart, Motherless Brooklyn και Pride and Glory. Στα δύο τελευταία θα έχει και πρωταγωνιστικούς ρόλους ενώ στο Motherless Brooklyn θα υπογράψει και το σενάριο, το οποίο θα είναι μεταφορά από γνωστό βιβλίο.

Ο Έντουαρντ Νόρτον σε συνεργασία με τον αδελφό του, Jim Norto, δημιούργησε την εταιρεία παραγωγής ταινιών Class 5 Films, στην οποία συμμετέχουν επίσης ο συγγραφέας Stuart Blumberg και ο παραγωγός Bill Migliore. Η εταιρεία ανακοίνωσε μια νέα συνεργασία με την Plan B του Brad Pitt και το National Geographic για την παραγωγή μιας σειράς δέκα επεισοδίων για το HBO, βασισμένη στο βιβλίο Undaunted Courage του Stephen Ambrose. Το The Painted Veil είναι η πιο πρόσφατα παραγωγή της Class 5. Άλλες παραγωγές της Class 5 είναι τα The Great Rivers Expedition και Dirty Work ενώ συνεργάστηκε με την Sea Studios Foundation για την παραγωγή του Strange Days on Planet Earth για το National Geographic.

Ο ηθοποιός έχει ακόμη διευρυμένη κοινωνική και περιβαλλοντική ακτιβιστική δράση, ενώ υποστηρίζει οικονομικά διάφορα projects όπως τα Nature Conservancy's Yunnan Great Rivers, Grand Canyon Trust, EarthJustice, Wilderness Society, Southern Center for Human Rights, American Museum of Natural History, Credit Where Credit is Due, American Visionary Arts Museum και Johns Hopkins Neuro-oncology Research Lab.